Ген, превращающий бактерии в супербактерии, распространяется в больницах и на фермах.

В 2003 году группа учёных сделала тревожное открытие в моче пациента японской больницы: штамм кишечной палочки Escherichia coli с ранее неизвестным геном, который делал микроб устойчивым к целой группе антибиотиков. Японские исследователи назвали этот тревожный фрагмент генетического материала npmA, что превратило микроорганизм в супербактерию, невосприимчивую к аминогликозидам – семейству препаратов, включающему в себя некоторые известные препараты, такие как стрептомицин и гентамицин. Микробиолог Бруно Гонсалес Зорн объясняет, что с тех пор npmA превратился в «призрак», который бесшумно распространяется. Его команда проанализировала два миллиона бактериальных геномов и обнаружила, что вариант гена npmA2 распространился по больницам и фермам и достиг как минимум шести стран. Эта бактериальная адаптация в сочетании с другими может сделать некоторые инфекции «практически неизлечимыми», предупреждает Гонсалес Зорн.

Появление устойчивых к лекарствам микробов — «одна из самых серьёзных угроз», стоящих перед человечеством, предупредили главы государств и правительств, собравшиеся в штаб-квартире Организации Объединённых Наций в Нью-Йорке 9 сентября 2024 года. Чуть более пяти лет назад Всемирная организация здравоохранения зафиксировала 1,3 миллиона смертей, непосредственно связанных с устойчивыми к лекарствам бактериями. Каждый пятый из погибших — ребёнок в возрасте до пяти лет. Ген npmA2 — это новое оружие, способное передаваться от одного микроба к другому.

«Мы обнаружили начало глобального распространения», — объясняет Гонсалес Зорн, профессор факультета ветеринарной медицины Мадридского университета Комплутенсе. Его команда идентифицировала этот ген в Великобритании, Германии, США, Австралии, Китае и Франции, в первую очередь у бактерии Clostridioides difficile , вызывающей диарею, которая может быть фатальной у ослабленных пациентов. «Обычно механизмы резистентности не приводят к устойчивости ко всему семейству антибиотиков. Не существует единого механизма резистентности ко всем пенициллинам или всем тетрациклинам, но этот механизм приводит к устойчивости ко всему семейству аминогликозидов», — объясняет Гонсалес Зорн, советник Всемирной организации здравоохранения.

В исследовании был проанализирован геном из международной базы данных AllTheBacteria . Результаты показывают, что наличие этого гена по-прежнему встречается «редко»: около 100 случаев обнаружения у бактерий Clostridioides difficile , что составляет 0,34% от общего числа исследованных. Этот ген также был обнаружен в голландской больнице во время вспышки Enterococcus faecium , микроба, который может вызывать смертельные инфекции у госпитализированных пациентов. В исследовании, опубликованном в четверг в журнале Nature Communications , участвовали учёные из семи организаций, включая Французский институт Пастера и Британский Кембриджский университет.

«Нам нужно действовать сейчас, чтобы обнаружить этот ген как можно раньше», — говорит Гонсалес Зорн. «Мы часто обнаруживаем новые гены после того, как они уже появились во многих отделениях интенсивной терапии во многих странах , и уже слишком поздно . Однако на этот раз мы увидели, что он распространяется скрытно и не присутствует в Испании. Сейчас очень хорошее время, чтобы разработать инструменты для его обнаружения и предотвращения распространения. Или, по крайней мере, иметь возможность обнаружить его на ранней стадии, чтобы изолировать пациентов и знать, с чем мы боремся», — добавляет микробиолог. «Если бы мы обнаружили его в 20 или 30 испанских отделениях интенсивной терапии, это была бы катастрофа; было бы слишком поздно. Хорошо, что у нас еще есть время, чтобы с ним бороться, но мы должны действовать сейчас».

Рафаэль Кантон , заведующий отделением микробиологии мадридской больницы имени Рамона и Кахаля, хорошо осознаёт опасность супербактерий. Он начал работать там в 1988 году, когда лабораторные исследования показали, что микробы восприимчивы к широкому спектру антибиотиков. С тех пор чрезмерное использование лекарств привело к появлению резистентных штаммов, даже ко всем доступным препаратам . «Аминогликозиды — это антибиотики, которые широко используются в сочетании с другими, например, при лечении туберкулёза или бактерий, вызывающих ИВЛ-ассоциированную пневмонию в больницах. Я обеспокоен [глобальным распространением гена npmA2], поскольку мы продолжаем терять группы семейств антибиотиков», — сетует Кантон.